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Zuguang Gu 开发的 ComplexHeatmap 包实现复杂数据的可视化,用以发现关联数据集之间的模式。特别地,比如基因数据、生存数据等,更多应用见开发者的书籍 ComplexHeatmap 完全手册 。 R 包发布在 Bioconductor 上 https://www.bioconductor.org/packages/ComplexHeatmap。使用之前我要确保已经安装 BiocManager 包,这个包负责管理 Bioconductor 上所有的包,需要先安装它,然后安装 ComplexHeatmap 包 [19]。
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
::install("ComplexHeatmap") BiocManager
参考文献
[19]
Z. Gu, R. Eils, and M. Schlesner, “Complex heatmaps reveal patterns and correlations in multidimensional genomic data,” Bioinformatics, 2016.